Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf50Q5SZB4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf50Q5SZB4 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf50Q5SZB4 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf50Q5SZB4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf50Q5SZB4 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf50Q5SZB4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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