Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms