Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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