Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms