Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPRL3Q12980 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NPRL3Q12980 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms