Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms