Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms