Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms