Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms