Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2P78314 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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