Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBP2P32456 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBP2P32456 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBP2P32456 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms