Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms