Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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PTPRMP28827 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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PTPRMP28827 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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