Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXD10P28358 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXD10P28358 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXD10P28358 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXD10P28358 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXD10P28358 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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