Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD1P28340 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms