Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GIPC1O14908 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms