Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms