Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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