Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms