Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NICN1Q9BSH3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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