Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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HDAC11Q96DB2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDAC11Q96DB2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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