Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms