Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLD3Q8IV08 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PLD3Q8IV08 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms