Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms