Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC4Q5GLZ8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms