Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKDCCQ504Y2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms