Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC3P51654 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms