Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms