Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms