Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms