Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA5P28066 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms