Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms