Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1P21675 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms