Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC9A1P19634 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms