Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DMDP11532 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DMDP11532 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DMDP11532 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms