Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CLDN34H7C241 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CLDN34H7C241 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms