Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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GGTLC3B5MD39 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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GGTLC3B5MD39 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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GGTLC3B5MD39 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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GGTLC3B5MD39 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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GGTLC3B5MD39 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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GGTLC3B5MD39 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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GGTLC3B5MD39 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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