Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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