Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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