Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms