Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRRTQ9BXP5 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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