Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LYSTQ99698 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms