Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms