Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM47Q96LD4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms