Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms