Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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HDAC11Q96DB2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HDAC11Q96DB2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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