Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN4Q92575 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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