Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms