Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms