Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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